Siamo al 31 Dicembre 1999 e tutti sono in fermento per l'arrivo del nuovo millennio. C'è però in agguato il famigerato Millennium Bug: tutti i computer cesseranno di funzionare, gli aerei precipiteranno e le testate nucleari esploderanno! Soltanto Peter ci crede e costringe la sua famiglia a rimanere al riparo nello scantinato di casa. A quanto pare la fine del mondo arriva sul serio. Peter suggerisce di spostarsi e cercare una fabbrica di Twinkee per sopravivvere. Anche questa volta il ciccione ha ragione ed è proprio presso questa fabbrica che viene inaugurata una Nuova Quahog. Tutto procede bene finchè i Griffin non vengono cacciati per una nuova idea di Peter (giusta anche questa) di armarsi per eventuali attacchi dall'esterno. La popolazione brucia le armi ma un esercito di Stewie in versione mutazione genetica attacca la città!